Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms