Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2AQ12879 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
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