Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLEQ07864 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLEQ07864 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLEQ07864 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms