Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms