Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms