Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms