Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIM1P81133 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIM1P81133 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIM1P81133 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms