Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MAP3K9P80192 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP3K9P80192 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms