Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRX1P78414 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRX1P78414 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRX1P78414 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRX1P78414 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRX1P78414 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms