Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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TMEM258P61165 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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