Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPAP53621 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPAP53621 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms