Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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