Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms