Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TGFBR1P36897 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms