Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms