Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTR2AP28223 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR2AP28223 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms