Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms