Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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