Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms