Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSRP1P21291 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms