Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASA1P20936 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASA1P20936 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASA1P20936 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASA1P20936 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASA1P20936 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms