Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms