Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM10L1P0DMW3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM10L1P0DMW3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms