Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBP07199 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBP07199 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms