Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFLP07196 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFLP07196 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms