Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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