Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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