Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SATB2Q9UPW6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms