Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX6Q9UNH7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms