Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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