Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC24A2Q9UI40 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms