Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms