Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00474Q9P2X8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms