Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS2Q9NYR9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms