Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL12Q9NXK8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms