Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms