Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms