Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSHZ2Q9NRE2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms