Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms