Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLCO1B3Q9NPD5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms