Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms