Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ROPN1BQ9BZX4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms