Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LRRC2Q9BYS8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRRC2Q9BYS8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms