Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC3Q9BY71 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC3Q9BY71 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms