Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms