Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms