Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms