Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms