Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms