Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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